ТО проходить не надо, так как лодку не надо регистрировать. Сейчас талон не выдают, а вписывают отметку о прохождении ТО в судовой билет, которого у вас нет и который вам не нужен. Нет регистрации - нет техосмотра.
Налог начисляется с момента регистрации. Вы можете снимать мотор с регистрации, когда он не используется (во время запрета навигации), а потом снова ставить. За этот период тогда налога платить не придется.