У каждой из них свои плюсы и минусы.
Пайольная.
Плюсы:
+ жесткий пол
+ делимый вес (удобно транспортировать)
+ ремонтопригодна в полевых условиях
+ не критична к условиям эксплуатации (без особой осторожности можно причаливать к берегу на камни, ходить по лодке без опасения порезать застрявшим в протекторе сапога камушком и прочее)
+ большой выбор моделей (многое в наличии)
Минусы:
- общий вес комплекта
- специфика сборки-разборки (время и относительная трудоемкость)
- мотор потребуется чуть большей мощности для выхода на глиссирование

С надувным дном.
Плюсы:
+ Комплект легче пайольной
+ Простота сборки-разборки
+ не столь требовательна к мощности мотора (выход на глисс обеспечит мотор меньшей мощности)
Минусы:
- при меньшем общем весе комплекта может оказаться, что одному лодку будет тяжело переносить из-за неделимого веса
- Придется быть аккуратным (выбирать место для швартовки на берег, следить, чтобы не пропороть дно о камни скрытые в воде, следить, чтобы на дно лодки не попало твердое-острое, что могло бы его повредить)
- в полевых условиях отремонтировать поврежденное дно крайне сложно, а чаще невозможно
- Если лодка большая (от 3,8 метров) придется дополнительно покупать хороший электронасос

По ходовым характеристикам все относительно и надо смотреть конкретные модели.

Вопрос:
Можно ли эксплуатировать надувную ПВХ-лодку с транцем на водоеме без регистрации при условии, что грузоподъемность лодки 225 кг., а подвесной мотор находится в лодке, т.е. просто лежит на полу? Т.е транспортируется.

Ответ:
В подобном случае регистрация лодки не требуется, эксплуатация допустима.

Да. Если лодка (катер) вписана в судовой билет, то это является документом подтверждающим ваше право собственности на данное судно.

Регистрация в ГИМС такого типа плавсредств необходима. Но если понтон не промышленного производства и Вы не озаботились этим вопросом до постройки, то зарегистрировать его в ГИМС будет сложно. Читайте правила регистрации маломерных судов и узнавайте подробности Вашего случая по телефону ГИМСа, где предполагается регистрация.

Вопрос:
Можно ли зарегистрировать лодку в регионе отличном от места прописки, если в данном регионе нет вообще никакой регистрации?
Спасибо!

Ответ:
Что это за регион такой? ГИМС МЧС действует на территории всей России, так что регистрировать лодку нужно в любом случае. А вот сделать это можно не только по месту вашей прописки, но и по месту базирования лодки.